但是从长远角度出发，西原借款为多年后日本在中国的军事行动打下了良好的基础。首先，他们通过西原借款得以巩固和扩张在东北的势力，从东北获得更多的有形以及无形资产；其次，获得济顺、徐高铁路的项目，借此将势力延伸到京汉线和京浦线，同时加强了对山东的控制；再次，相关的军事借款让日本实质上掌控了中国军队的武器提供，中国的军火交易订单几乎全落在了日本人手里。同时因为西原借款，日本得以在东北和山东派驻越来越多的军队，这不仅为日后的五四运动埋下伏笔，也为将来的日本侵华埋下隐患。
在西原借款的计划开始运作之后不久，段祺瑞就迫不及待地开始实施“武力统一”的计划了。自第二次组阁开始，段祺瑞就已经不抱依靠政治手段完成统一的念头，转而靠武力统一中国。要统一中国，他的敌人首先就是西南系军人，包括云南、贵州、四川、广东和广西五省，按照段祺瑞与徐树铮的计划，他们准备由四川进攻云南和贵州，由湖南进攻广东和广西。当时四川的局势比较复杂，北洋系的势力已经渗入，所以段祺瑞就把主要精力放在了湖南。湖南距离北洋系的占领区比较近，尤其是距离段祺瑞的皖系势力范围较近，加上湘军的实力不强，经过研究段祺瑞决定由湖北和江西两路夹攻湖南。